Wieder einmal übernimmt der Spieler die Rolle von Howard E. Loreid und wird in eine Welt versetzt, die mit jedem Schritt düsterer wird. Howard findet heraus, dass seine eigene schreckliche Vergangenheit mit dem Wahnsinn in Zusammenhang steht, der über ihn hereinbricht.
Dark Lineage bringt dich an Orte, wo die Vergangenheit immer noch lebendig ist und Erinnerungen, die eigentlich vergessen sein sollten, immer noch gegenwärtig sind; einschließlich einer schläfrigen, depressiven Stadt namens "Arkhamend", einem viktorianischen Haus, das eine Menge schrecklicher Geheimnisse birgt, einem verfallenen Gebäude in einem berüchtigten, schneebedeckten Wald und dunklen Gebäuden und Tunneln im Untergrund.